為降低少子化對各級學校招生的衝擊，教育部開始採取因應措施，第一步是針對招生困難的私校啟動退場機制，如果連續二年招生不足五成，就停止給予補助款。此一整頓措施對私立大學影響重大。

各級私校因招生不足，以致學費收入減少、校務無法推動，影響師生權益之情事時有所聞。最近連續發生永達技術學院、崑山中學減薪、欠薪等事件，引起社會關注，更凸顯了私校生源減少的問題。

據教育部統計，預估從一○○學年到一○五學年，國內大學每年減少五千七百名新生，預估到一一二學年，新生人數將減少到十七萬八千人，比一○○學年少了三分之一，如此巨幅的人數降低，國立大學與中學都受不了，遑論生存已經困難的私校。

教育部首度決定，將私校招生率與補助款連動，如果連續二年新生註冊率低於百分之五十，就不得申請教育部補助款。由於教育部的補助款占私校每年總經費的百分之十至百分之二十，事關重大，此一措施必然會促使私校加強辦學品質，以吸引學生與家長的肯定，提高新生註冊率，達到教育部所訂的門檻。

相對的，辦學不力的私校則因缺乏補助款，勢必縮減學校規模，達到逐步退場的政策目標。

不過，教育部必須考慮的是，即使在目前未啟動退場機制的情況下，都連續發生私校欠薪、減薪事件，一旦有私校無法獲得教育部補助款時，此類事件必然更形增加。教育部必須根據各級私校辦學經營，及早掌握其財務狀況，擬定相對的配套措施，以免私校脫產、掏空等弊端再度發生，損及師生權益。

此外，教育部宣布的上述整頓措施要到民國一○五年才實施，也就是說，私校還有三年可以因應。教育部此舉是避免驟然實施，可能造成私校無法承受，以致產生不必要的紛爭。教育部的考慮並不為過，但就學生權益而言，則有商榷的餘地。

私校招生不足，除了少子化的大環境因素之外，與各校教學品質也有直接關連。社會一直呼籲教育部，應該公布各級私校的註冊率，供學生與家長參考，避免學生選錯校，白繳學費又學不到應有的知識與技能。

但對於公布私校註冊率，教育部的回應仍只是「考慮」、「不排除」，並未承諾予以公布。但教育部既然已經決定祭出招生率與補助款的連動政策手段，表示私校招生問題與退場已經到了不得不解決的地步，那麼除了政策面的手段之外，公布註冊率就是將選擇註冊的權力，回歸市場機制，由家長與學生主導，決定私校的生存與否。

教育部還有一個問題必須考慮，私校招生困難，一個原因是公私立學校學費的差異；教育部將公立學校合併變大，吸收了大量學生，私校自然招生不足。而規模大的公立學校未必就能培養出有用的人才。

在未來生源愈來愈少的情勢下，只要三、五所公立大學就夠了；是否將來學校全為公立，如以往共產主義社會一般。