日本四面環海，資源缺乏，長久以來便極力向海洋拓展以求生存，不只和台灣、中國有釣魚台列嶼主權糾紛，和俄羅斯、南韓也都有領土爭議，與中國甚至還有油氣田歸屬問題。

日本與俄羅斯，因前蘇聯在二戰結束前，強行侵占南千島群島（日本稱「北方四島」，位於北海道外海），領土爭議使得兩國關係60多年來，始終處於膠著狀態。儘管雙方曾就此問題進行談判，試圖找出破解僵局的可能方法，但關係依舊敏感。2006年俄羅斯巡邏艇，甚至開槍打死一名接近該海域的日本漁民，引發兩國外交緊張。

日本與南韓，則為了獨島（日本稱「竹島」，位於日本海）問題，關係更是緊張。該島目前實際由南韓管轄，2006年日本派遣勘查船到獨島，引發南韓強烈抗議，政府不但派遣軍艦巡視，後來還開放民眾登島遊覽，日本也以國民設籍、編入教科書解說書中等方式加以反擊，雙方你來我往，用實際行動宣示主權。

此外，近來為了東海油氣田開採問題，日本更是摃上了中國。此爭議始於2004年，日本認為這些油氣田位於「日中中間線」，但中國大陸卻片面開始開採該區天然氣，日方於是提出強烈抗議。儘管中國大陸依舊不承認所謂的「中間線」，本周雙方發表共同聲明，將採合作方式開採東海，互利共贏的未來出現曙光。