為何海洋會酸化？台灣海洋大學海洋環境化學與生態研究所助理教授周文臣表示，這是因為二氧化碳與水混合後產生碳酸，造成鹼性的海水酸度增加，酸鹼度的pH值降低，改變物種分配的比例，使環境生態受到影響。

酸性高的環境會溶解鈣質，例如珊瑚以分泌碳酸鈣，形成鈣質骨骼生長，海水愈酸，會分解有機生物外殼中的碳酸鈣，需要合成碳酸鈣的生物成長能力變差，有滅種的危機。

「面對海水溫度上升，首當其衝就是無法移動的生物，」中山大學海洋環境及工程系教授楊磊有感而發表示，無論是珊瑚還是海洋植物都會因為溫室氣體的效應而遭到池魚之殃。

然而，更讓人擔憂的是，海水的汙染並非只有溫室氣體一種。楊磊表示，包括漏油事件所造成的油汙、化學藥劑汙染（物質性汙染），以及海底礦產的開採也都會造成人工汙染，這些不同類型的汙染正一步步地改變大海的面貌。

當中，還有一項不為人知的汙染，就是貨船「壓艙水」所導致的海洋生態失衡。楊磊解釋，全世界每天有那麼多輪船來往頻繁，當貨船卸貨後，因為船身重量變輕，所以需要在當地汲取「壓艙水」來幫助貨船平衡，但當貨船行駛到目的地後 ，就會把壓艙水排放掉，因而破壞當地的生態平衡，這道理就如同國外的「外來入種」侵襲台灣的本土物種一樣，雖然負面影響不會馬上立竿見影，但日積月累下來卻是影響海洋生態甚鉅。