外來入侵種生物不但會影響一個區域的生物多樣性，對於台灣本身的民生經濟及生態環境的影響亦極大，因此政府特別在2004年公布十種常見且危害情況嚴重的外來入侵生物，分別是：

1.小花蔓澤蘭：原產地在中南美洲，是菊科蔓澤蘭屬的多年生藤本植物；會產生種子，但亦會利用匍匐經節或節間的不定根，進行無性繁殖；小花蔓澤蘭侵入台灣後，利用上述兩種繁殖方式快速生長，迅速佔領中低海拔山野開闊地，如溪谷、荒地、荒廢果園或檳榔園，且成長後會攀爬覆蓋其他植物，阻止其利用日光，造成被攀附的植物因無法進行光合作用而死亡，進而影響其他野生動物棲息，故被稱為「綠癌」。

2.福壽螺：又稱金寶螺，民國68年因食用理由引進台灣，但因口感不受國人歡迎遭棄養，加上繁殖力強且食性廣泛，有「見青即吃」的說法，台灣每年會因福壽螺造成的農田損失達10,000公頃；由於福壽螺入侵時間已久，且適應力強，故農委會每年都會編列1.3億新台幣預算進行防治，但僅能控制其數量，而無法將其根治。

3.布袋蓮：日據時代因觀賞理由而引進台灣，時至今日，台灣至少有六萬公頃的水域被布袋蓮所覆蓋，以嘉南平原溝渠及埤塘最多，常導致排水溝渠或水庫發電廠水閘門堵塞；由於布袋蓮是以無性繁殖方式來增加族群數量，當水面整個被布袋蓮覆蓋後，會造成水質缺氧，除了讓原本棲息於其中的生物無容身之處外，原本的水域反而成為其他對水中溶氧度需求度較低的病媒生物的棲息場所。

4.松材線蟲：松材線蟲是松樹萎凋病的病源，但因本身無法主動在松樹之間自由行動，所以得仰賴松材線蟲的中間寄主—松斑天牛的傳播。松材線蟲是一種植物寄生性線蟲，一生可以分為生殖期與傳播期，生殖期的松材線蟲並不會危害松樹，但進入傳播期後，藉由松斑天牛的間接傳播，感染松樹，使其停止生長，松樹的針葉逐漸退色，而後蔓延至其他枝條，最後造成整株松樹萎凋死亡；松材線蟲目前危害的樹種除了外來種的琉球松、黑松外，本土的二葉松亦受到波及，每年受害面積達4000公頃，損失金額約5.7億新台幣，嚴重影響台灣林地的造林成果。

5.入侵紅火蟻：紅火蟻的分類地位屬於蟻科、火家蟻屬，外觀與一般常見螞蟻無太大差異，但蟻丘外觀卻大不同，入侵紅火蟻的成熟蟻丘有如一座小火山，高出地表約10~30公分，直徑30~50公分，當有外力干擾時，成群火蟻有如火山岩漿般傾巢而出，集體攻擊外來物體；在2003年入侵台灣的桃園及嘉義地區後，已有不少民眾受紅火蟻攻擊；而不只攻擊人畜，紅火蟻也會影響作物種子、根、嫩芽，及威脅土棲生物（如蚯蚓）的生存。值得慶幸的是，經過國家紅火蟻防治中心及相關部會合作，紅火蟻防治率達九成以上，台灣可能繼澳洲後，成為第二個根絕入侵紅火蟻的國家。

6.中國梨木蝨：此類生物的入侵主要藉由走私稼接苗而入侵台灣。梨木蝨，並不是指單一種生物，而是泛指依附梨樹生活的木蝨，此類取食梨樹的木蝨，在歐洲有紀錄可查的有20種以上，而在中國大陸發表的也有20餘種，梨木蝨僅危害梨樹，主要藉由刺吸嫩芽、嫩梢及葉片汁液而影響梨樹生育，嚴重可造成受害葉片褐化、枯死、落葉。另外蟲體會分泌蜜露而誘發煤煙病，在樹體表面形成煤污而阻礙陽光，影響光合作用。幸好中國黎木蝨疫情僅發生於台中東勢、和平、新社、苗栗卓蘭、南投仁愛等地，於2004年經過共同防治後，已無進一步疫情發生。

7.蘇鐵白輪盾介殼蟲：蘇鐵白輪盾介殼蟲入侵情況亦類似中國梨木蝨，藉由走私的蘇鐵苗木，自越南入侵台灣，目前全台皆可發現，但以北台灣為主要分布地區；蘇鐵白輪盾介殼蟲可危害蘇鐵全株，包括葉片、莖球及根部等，常在葉片基部、葉軸和羽狀小葉的下表面吸食汁液，使葉片黃化枯萎、脫落，嚴重可導致全株枯死。

8.河殼菜蛤：分類上屬於軟體動物門、二枚綱、貽形目、殼菜蛤科，於1940年代進入台灣，主要分布台灣中部以北水庫與集水區等，如石門水庫、日月潭大觀電廠等。河殼菜蛤會影響水力發電及改變湖泊或河川生態體系，使生物相單調化，還會影響水管系統正常運作。但目前對河殼菜蛤的防治並無有效的治本之道，僅能定期刮除監控。

9.緬甸小鼠：1999年5月首度發現，主要分布在花蓮吉安鄉木瓜溪北岸區域，會傳播人畜共通疾病，同時危害水稻等農作物。

10.多線南蜥：1992年由日籍學者Ota教授及中山大學教授張學文與劉國強於高雄澄清湖及美濃鎮中正湖首度發現，主要分布於枋寮以北至台南縣仁德鄉之間的平地鄉鎮、七股沿海防風林內，墾丁、斗六等地區亦有零星發現紀錄。目前多線南蜥被認為「可能」是造成南部平地地區石龍子及草蜥等共域物種數量稀少的原因，由於牠們的食量大且來者不拒，有掠食本土種現象，如果入侵範圍繼續擴大，將可能導致本土種蜥蜴滅絕；但目前尚無積極有效的防治方法，只能加強進出口防檢及杜絕走私。