很多人認為，引起感染類疾病的原因是病菌。事實上「病菌」這個詞從醫學角度來講是一個很不嚴格的稱謂。「病菌」不能包括這類疾病的全部致病因素。

導致感染類疾病的最重要病原微生物包括三大類：病菌（包括衣原體、支原體、克立茲體、螺旋體等類別）、病毒及真菌。

最強悍的敵人：病毒　

病毒是最簡單的病原微生物，也是最難治療的。

當一個病毒要繁殖的時候，它會選擇一個正常的人體細胞，想辦法進入，然後像寄生蟲一樣吸取內部的營養，並自我複製成為幾個病毒，再從人體細胞中出來，如此反覆。目前醫學界真正有效的抗病毒藥物，只有屈指可數的幾種，而能將某種病毒悉數消滅的特殊藥物，幾乎不存在。

最頑固的敵人：真菌　

據專家分析，真菌類疾病難以根治之因是：一.真菌在致病過程中作用環節少。二.真菌有一種叫做孢子的物質，它會感染周圍環境如衣物鞋襪，這就是腳氣等體表感染類疾病難以根治之因。

最隱蔽的敵人：細菌　

細菌屬於原核細胞型微生物，而人體細胞屬於真核細胞。人類要想對付細菌，只需找尋一些專門殺死原核細胞的物質。人體服用此類藥物後，原核細胞類的細菌就能被殺死，而屬於真核細胞類的人體細胞安然無恙。

這種物質就是抗生素。然而，抗生素並不是對所有的細菌都起效，抗生素的選擇性和針對性很強，一種抗生素能消滅的細菌就那麼一種或者幾種。