教育部次長吳財順指出，目前高中以下校園全面禁菸，校長如果有抽菸習慣，要說服學生不要抽菸，立場薄弱。菸害防制策進會去年要教育部考量將「不吸菸」納入校長遴選資格參考條件，教育部才發文縣市政府研議未來校長甄選時，將抽菸習慣納入遴選條件，但建議可採漸進宣導方式。

吳財順強調，菸癮不是說戒就能戒，為顧及現在有意參選校長者的權益，教育部建議縣市採漸進式宣導，要有三部曲，不是馬上就列入遴選條件，未來即使考慮要執行，也要一段時間，例如三、五年後，且最好先辦公聽會，聽取各界意見，有共識再執行，避免爭議。

有縣市依據教育部發文，已將不吸菸納入校長遴選條件，吳財順說：「這件事今天講、明天就做，並不適宜。」教育部會發文提醒縣市注意。

吳財順表示，因為高中以下校園自九十八年起就不能抽菸，教官如果抽菸，卻要學生不抽，很難說服學生，因此要求要從軍中轉到校園擔任教官，不吸菸者才可以，若轉了教官又抽菸，就要註銷資格回軍中，執行了幾年，相當成功。

教育部調查高中以下校長吸菸情形，國小有一百零七人，約占百分之四點零七；國中有三十一人，約百分之四點零五；高中有八人，占百分之二點二五；高職有四人，約百分之二點一五。

教育部發文內容還包括：「鼓勵有抽菸習慣的老師，如果有參加校長甄選的生涯規畫，宜先戒除菸癮，再參加校長甄選。」

彰化縣教育處長林田富表示，校長遴選以學識、能力為主。身為教育推動者，如何落實校園環保，教育工作者的身教也很重要，他支持教育部的構想，希望國中小校長不要抽菸，但抽菸是個人行為，只要不在校園內抽菸，不需強制作為遴選校長的規範，列為遴選參考項目即可。

國家教育研究院院長吳清山則認為，不論憲法、教育人員任用法或菸害防制法中，都沒有規定吸菸者不能選校長，站在法的立場，如果將「不吸菸」列入校長遴選條件，會有違反人權或工作權等的爭議。