關渡地區淡水河一帶的魚貝資源除了鰨沙、鱸魚、赤鰭這三類的高級魚種之外，其實還有許多豐富的漁業資源，這些資源在過去也是相當重要的角色。

下面介紹的三種水生動物，在現在關渡地區的淡水河段還看得到，但是數量已經遠遠不如以往。

1.烏魚

烏魚主要棲息在沿海的沙泥底，經常在河口、紅樹林等半淡鹹水域生活。五十年前的淡水河，還沒有受到污染，春初時分，烏魚苗便會從淡水河口成群游入關渡。到秋末時節，迴游淡水河的烏魚自各河段下降到關渡，準備出海產卵，這有別於在台灣海峽以及東海一帶的迴游性烏魚，自成一個相當有趣的族群。而今日河水受到污染，烏魚大多只游到淡水河口，就無法在繼續往淡水河的上游前進。

2.鰻魚

鰻魚也是迴游性魚類，棲息在河流底層與洞穴中，春季牠們會回到海中交配產卵，鰻苗孵化後，會找尋淡水，順著河流潮汐上溯到上游成長，現今污染的淡水河，即使到了鰻苗上溯的季節，也只能在河口撈到幾條鰻苗，過去在淡水河到處都有鰻魚的景象，已不復見。

3.蟳

淡水河裡曾經紅蟳、菜蟳、青蟳都有，蟳潛於河底或灘地泥洞，很少爬上岸，三種蟳其實都是同一類型的螃蟹；而所謂的「菜蟳」指的是雄蟹或未交配過的雌蟹。目前常見的青蟳是一種夜行性動物，喜歡生活在紅樹林附近的沼澤地，是一種雜食性動物，幾乎什麼都吃，因此在以往的魚蝦豐沛的淡水河，常可以找到體型碩大的青蟳，現在要看到體型碩大的野生青蟳，可說是難上加難了。