唐代的慧苑法師為華嚴三祖法藏大師的六位上首弟子之一，如此聰明優秀者，為何在法藏入滅後被同門師兄弟擯除呢？原因在於慧苑的學說帶有批判性，不見容於當時。

《華嚴經》八十卷本於法藏晚年譯出，一生弘揚本經的賢首國師（時人對法藏的敬稱）不免要執筆書釋，但僅寫了十九卷就去世，便由弟子宗一、慧苑續筆。宗一續滿二十卷，其文現已失佚；慧苑所續名為《續華嚴經略疏刊定記》，今收於卍續藏第五冊，但已殘缺不全。

據慧苑自述，此書是他「鳩集廣略之文，會撮舊新之說；再勘梵本，仇校異同……」而成。照理說應是極具分量的著作，然而書中最大問題在於：

一、判教思想的差異。法藏大師把佛之一代時教立為「五教」，慧苑則改為「四教」。

二、「十玄緣起」說的差異。由二祖智儼奠基、三祖法藏發揚光大的「十玄門」，慧苑改作「十種德相」和「十種業用」兩重說。

以上兩事讓華嚴宗人視為違逆師尊與宗門，遂把他自華嚴族譜擯除。後人尊澄觀為四祖、宗密為五祖，而無慧苑之名。

法藏的「五教」是指小教、始教、終教、頓教、圓教；慧苑認為這不過是對天台四教加上一個「頓教」而已，並無新意。慧苑說：「頓教亡詮顯理，如何立為能詮？若此是教，更詮何理？」、「若許離言總應名為頓，終、圓二教豈不離言？豈不頓乎？何有五教？」於是他另立迷真異執教、真一分半教、真一分滿教、真具分滿教，亦即認為此「四教」優於原來的「五教」。

由於此說複雜，本文僅能簡述其前因後果，若欲詳細探究，可參考許多學者的研究成果。

慧苑最大問題在於批判其師法藏、另立新說，這在當時是被視為離經叛道的。四祖澄觀批評由「五教」變「四教」使得權、實不分，漸、頓難辨。而「十玄緣起」改成「德相」、「業用」兩重則徒增繁瑣。然而近代的太虛大師卻讚許「慧苑四教統觀內外，亦有恰當處」。

要言之，慧苑是個受爭議的人物，不過，他所寫的《慧苑音義》（梵音之語言學）對後世貢獻良多，他應該可堪告慰吧。