國內飲用水安全現階段面臨之五大問題（1）水源水質汙染、（2）水源水量不足、（3）傳統處理程序功能有限、（4）營運管理組織體系不健全、（5）配水系統水質、水量、水壓之安全性及穩定度尚待加強。其中有關水源水質汙染包括：原水遭受汙染含有機物及氨氮、水源保護區受破壞、及水庫優養化等現象更值得國人重視。為因應全球氣候變遷，本文依據「台灣二十一世紀議程」與「國家永續發展願景與策略綱領」所揭示之「永續水環境」政策，參酌歐、美、紐、澳等國水質管理法規制度及處理技術規範等，提出建置水庫水質調適策略如下：

一、加強水源保護與集水區管理，執行國家飲用水水源評估計畫，依據國家飲用水水質標準將公共給水水源分類，由水源保護觀點重新評估國土規畫與發展計畫畫定水源保護區；列出可能的汙染行為或活動（Possible Contamination Activities, PCAs），進行水源集水區流域調查研究，其內容包括：流域區的普查與描述、PCAs的普查與描述、流域管理與控制措施的描述、水資源的連結整合使用，並訂出管制PCAs的優先順序；降低點汙染源，在水源保護區內，興建下水道之收集截流系統與處理設施及加強養豬廢水的處理，並提升其處理效能；降低非點源汙染；在水源保護區內，特別加強國土保育政策與最佳管理操作（BMP）之落實。

二、建構水質監測規範網路，發展監測網絡建置，為增加了解汙染物質在環境中的存在及潛在風險，發展監測網絡有其需要。監測網絡應該包含新興汙染物（Compounds of Emerging Concerns），監測網絡主要考量重點包括：來源與承受量的質量平衡、經由廢水處理廠的宿命、經由自來水處理廠的宿命、在環境中的濃度：沉積物、地下水、表面水及動植物、生態的風險評估及現地研究影響報告、人類健康風險評估及分析方法。

三、建置水庫水質監測QA／QC制度，強化系統監測與認可制度，建立針對各監測特性之採樣計畫，包括地點與採樣；確保監測數據之代表性與可靠性，建置需用之內部與外部報告機制；建立水質申報與審查制度，將所有水庫水質管理之資訊建檔，建立紀錄管理系統並確定員工受過填寫紀錄之相關訓練，定期檢討檔案並視需要進行修訂，製作可供部會機關及相關單位取得之年度報表；建立水質審查與評鑑制度，蒐集且審查長期數據並建檔，評估執行成效，並提出因應對策，提升效能。

四、建立水庫水質環境評估制度，背景資料收集包括：地理環境、氣象與水文、生態環境、人文社經及現有水力設施；庫區水質及底泥採樣試驗包括：庫區水質定點監測、庫區水質定點採樣試驗、庫區底泥定點採樣試驗；進水口水質及底泥採樣試驗包括：進水口水質定點監測、進水口水質定點採樣試驗、進水口底泥定點採樣試驗；三維水庫動態數值模式包括：模式建構、率定與驗證、情境模擬、結果分析；資料整合及評估：監測系統整合、環境影響評估、防範對策、成本效益分析。

因應全球氣候變遷宜建置水庫水質調適策略，其具體策略與措施為：（1）建置水庫水質管理制度、水質監測管理體系之建立、強化水源集水區流域調查、水質監測與評估計畫等；（2）汙染源清查資料庫建置，汙染源資料庫應包括汙染源位置（配合GIS地圖）與汙染源特性、排放量、汙染物種類、排放口照片等，將汙染物依其重要性與急迫性訂出優先順序並強化源頭管制；（3）建立緊急應變體系，包括：脆弱點評估，應變措施與定期演練，組成應變中心組織，初步評估影響程度；（4）集合應變小組（評估、分析、安全、供水、溝通、搶修、健康等），通知相關單位，媒體溝通，健康風險，以確保安全可口的飲用水水質，降低淨水處理之成本，維護水資源及永續經營。