故事發生在二一五四年，那是一個人類生存於科技發達卻已耗盡地球資源的年代，於是到生物繁茂的潘多拉星球上開採珍稀礦產。為了便於對潘多拉星球的研究，科學家們還培養出人類DNA與納美人混血的生物高科技「阿凡達」研究實驗。負傷的前海軍陸戰隊員傑克，在因緣際會下，加入了旨在占領並利用納美人的星球行動。

如果這是部擴張主義與生物多樣性對抗的電影，充其量不過是部自然和文明衝突的影片，但別忘了，主角頂替的是意外身亡的雙胞胎兄長，他是生物科學團隊的一員，有著濃烈的理想主義和人道關懷。

導演與編劇讓傑克以地球人的靈魂使用阿凡達的身體，再學習納美人的生活和文化，難保不出現衝突，因此，當他與蒂莉公主發生了偉大的化學反應時，固然違反了遊戲世界的禁忌規則，卻實踐了觀眾的期待，因為「違規」是人性王道的逾越冒險。

傑克與納美人的相處，是他真實個性的展現，他為一探究竟，可以無懼無畏，還引出了聖樹種子的奇異挑選；他本性善良、天真，雖屢被嘲笑戲謔，到達山頂時，仍能無懼的駕馭靈鳥高飛，通過試煉。

問題是，傑克早先曾是位訓練有素的海軍陸戰隊員，豈不深諳軍紀，誰知短短三個月就成了背叛地球文明與利益的人。是什麼因素讓他每日穿梭於真實與夢境時，不是由人類的視角看見納美人的落後、野蠻和無知，卻反轉為直視人類的自以為是、詭詐殘暴？

就某一層面來說，傑克正受到現實的本我與道德的自我衝突，有一幕是傑克對著影像日記說：「我已經不知道自己到底在哪，才是真正的活著，彷彿現在是一場惡夢」；他的心靈像一座冰山，能夠被外界看到的行為表現或應對，只是露在水面上很小的一部分，而暗湧在水面之下更大的山體，則是長期壓抑並被我們忽略的「內在」，但它其實是可被召喚覺知的。

電影中，整體而言，掠奪的資本主義與霸道的軍國主義，代表著人類集體的陰暗面；當人類對靈性原則出現傲慢時，就可能會把我們推向陰暗的未來。

赤子之心讓傑克快速的在納美人中學習一切，赤子之心也讓傑克更厭惡上校貪婪無情心態，隨著傑克一次又一次融入納美人體系中，也愈出現萬物平等與人心險惡的細膩對比；因此，當上校下令要摧毀「家園樹」時，傑克的超我，也就是理想行為，即高高躍出人性。

這是一場冰山之旅，當你我願意揭開冰山的祕密時，才有緣一會萬物有靈的阿凡達。