台北縣南山中學的校徽很有趣，不僅顏色鮮明，設計也呼應校名，由三個綠、紅、藍的三角形所組成。

南山校徽造型簡潔有力，意涵深遠。校長王繼光表示，這個校徽是在民國八十年改制為綜合高中時，由學校老師腦力激盪創作。

創意來源取自於「山」的古字；三角形的三邊則代表天、地、人，象徵南山中學「以人為本」的辦學精神，藉此培養學生懂得人文關懷、愛惜生命的真諦。

除了圖案外，校徽顏色也擁有不同的教育意涵。綠色代表「成長」，希望學生能在品德、知識上有所成長；紅色代表「熱誠」，希望學生能對生命有熱忱、對人有熱情；藍色則代表「成熟」，希望每位學生都能對自己的人生勇於負責，擁有成熟的處世態度。校方期許透過校徽的顏色意涵，讓每位南山學子都能在求學歷程中有所成長、擁有熱情與成熟的人生態度。

王繼光說，身為一所綜合高中，南山中學的教育宗旨是希望能幫助每位學生發展出多元智能，發掘學生優勢潛能、培養能符合未來所需的一技之長。他強調，面對多元化的時代，教育之路也要走向多元，才能符合每個孩子不同的學習需求。