搭過高鐵的民眾都認為，高鐵快速、舒適，是一項交通新選擇。

但是，健全的轉乘機制是大眾運輸工具成敗的關鍵之一，高鐵現行各車站，除了台北板橋、台中、高雄左營能與捷運或台鐵系統相互銜接以外，桃園、新竹、嘉義、台南等站，只能利用計程車、公車、開車、騎摩托車轉乘，大幅延長搭乘時間，甚至民眾花在接駁的時間，可能多過搭乘高鐵運輸的時程。

試乘民眾高小姐反應，如果時間充裕，她會考慮搭乘台鐵自強號從台北市到高雄市，雖然時間多出三個小時，但可省去轉乘的麻煩，而且所需費用比搭乘高鐵標準車廂少了六百多元，也是一個較符合經濟的選擇。

由於各項公路建設陸續完工通車、台鐵積極提升服務品質、國內經濟成長趨緩，航空國內線客運量從二○○四年起逐年遞減，每年減幅達百分之十，現在加上高鐵獲准通車營運，國內線航空運輸經營可謂雪上加霜。

飛行北高航線的立榮、遠東、復興及華信等四家航空公司，去年已採取階段性逐步減班措施因應。以往幾乎每小時都有北高班機可搭的「搭飛機有如搭計程車」的方便景象不再，如今搭乘北高班機未事先訂位者，到機場後大都面臨得排隊候補的不便。

不過，也有民眾支持國內航空。試乘民眾張先生說，從台北松山機場到高雄小港機場，搭飛機所需時程不超過五十分鐘，若再加上提前報到、轉乘的時間，最多不超過四個小時，且飛機全票票價一張一千七百多元，與高鐵價格不相上下，若不是趕潮流，他會選擇搭飛機。

在影響方面，台鐵營收從三日起，連續三天減少五百萬元以上。台鐵分析營運減少的原因，主要是高鐵半價促銷所致，等未來高鐵票價恢復原價，台鐵還是具有優勢。

另一方面，雖然國內線航空運輸經營一年不如一年，但高鐵試營運至今，國內航線的平日售票、春節期間的訂位狀況堪稱正常，並未出現預期的衝擊，業者認為真正的影響要在春節輸運結束後才會出現。