舍利是遺骨之意，指修行者遺體焚化後，結晶而成的堅固子，如佛骨、佛牙、佛指舍利等，有別於凡夫俗子的遺骨，而是透過戒、定、慧熏修所成。阿羅漢或高僧大德透過修持，身後也多留有舍利。舍利分有全身舍利和碎身舍利二種，惠能大師是屬於全身舍利。

此真身曾遭遇過三次破壞，一次是六祖去世後不久，傳說新羅人夜盜真身首級，但因頸部有鐵片保護，沒能得逞。

第二次是日本侵華時，日本兵帶著醫生用的手術刀，從六祖背後剖開一個小洞，發現骨骼、內臟保存完好，嚇得日本兵頂禮膜拜而退。最後一次是文革時期，紅衛兵拿鑽子、釜具、火燒破壞，可說是最慘烈的了。