在美牛問題還無解之際，農委會公布彰化、台南檢出H5N2高病原性禽流感，但不是政府相關單位發現，而是紀錄片導演李惠仁主動寄病死雞給農委會，經化驗後證實，由媒體報導的事件經過，關鍵應在防檢局擅自提高高病原的認定門檻。

依李惠仁的說法，農委會防檢局六年前就已提高高病原的認定標準，如此一來，原本在國際規定的標準下，早就應該是通報為禽流感疫情，須採取撲滅與後續處理措施，卻在標準提高下，沒有「疫情」傳出，而私下處理，看起來是天下太平，可是潛藏的健康危機，卻悄悄地運到全台各地市場，消費者在毫不知情下食用。

美牛與禽流感都損及政府威信，及人民對政府的信任，防檢局長辭獲准，是應該承擔的政治責任，但當務之急是重新檢視防檢流程，堅持最嚴格的標準，若要想重建人民對政府的信心，就必須從這個堅持做起，以最高標準把關。

李惠仁是在六年前開追蹤調查，相關單位應明擅自提高高病原的認定標準是何時發生的，是誰容許的？防檢標準除了必須嚴格訂定，也必須是一貫的，不論是那個政黨執政，都應以同一標準嚴格要求，如此政府無論對內對外才能以一貫立場堅持，以確保民眾食的安全，更不會讓人民對政府失去信心。