傳染病一直是人類健康的大敵。台大醫院副院長、傳染病防治醫療網台北區指揮官張上淳表示，早年的傳染病如霍亂、傷寒、瘧疾等，都是上古時代就存在，不過對台灣民眾來說，由於公共衛生改善、抗生素使用、疫苗的涵蓋率非常理想，這些典型傳染病不致構成太大威脅。

然而，傳染病的型態逐漸轉變。張上淳回憶，台灣第一次遇到新興傳染病，是民國八十七年的腸病毒71型疫情；由於小孩子抵抗力較弱，造成四百多例重症、七十八例死亡，也讓當時最高防疫單位防疫處長下台。

台灣對「防疫」有全民共識，主要是歷經SARS洗禮，之後醫院感控要求更嚴格、建立更多隔離病房，各縣市都有專責醫院，也開始設立感染症防治醫療網，分區設立指揮官來調度。

緊接在SARS之後，就是國外H5N1禽流感出現禽傳人疫情，台灣不敢大意，針對新型流感提出防治計畫以及演練。民國九十八年當流感病毒轉變為H1N1大流行時，由於流感的性質是大規模傳播，但也最有機會透過疫苗來預防，剛好國內標走當年季節性流感疫苗的國光生技公司擴廠，適時提供自製疫苗，因此十一月一日就類似航空登機順序，進行全民接種。

NDM-1抗藥性細菌去年最早在印度被報導出來，十月四日一名在印度受槍傷的攝影師，被證實體內檢出帶有此菌，曾引起社會一陣恐慌。

張上淳表示，細菌或微生物的抗藥性愈來愈強是可預期的，必須雙管齊下來防治：第一是從源頭減少產生，避免抗生素過度濫用；第二則是要減緩傳播速度，因此必須加強院內感染控制，避免散播到社區。

傳染病的挑戰不會停止，尤其現在交通愈便利，傳播速度愈快，張上淳認為防治方法就是盡可能阻絕境外，或是延後傳染病進來的時間。此外，對於有疫苗可預防的傳染病，由於疫苗的保護力不是終身，什麼時機點應補接種，也是目前討論中的議題。