眼珠是由角膜、虹膜和瞳孔等組成的。角膜是無色透明的，瞳孔不變色，因此，眼珠的顏色取決於虹膜的顏色。

虹膜由五層組織構成。其中基質層、前界膜和後上皮層中含有許多色素細胞，它們含色素量的多少決定了虹膜的顏色。細胞含色素越多，虹膜的顏色越深，眼珠的顏色也就越黑；相反，顏色越淡。

而細胞的色素含量與皮膚顏色是一致的，還與種族遺傳有關係。亞洲、非洲人的虹膜中色素含量多，所以眼珠看上去是黑色的；白色人種的虹膜中色素含量少，眼珠呈藍色或灰色。