一九五八年，在陳族先生的引介下，高雄市長陳武璋先生拜會星雲大師，談及中央政府已開放壽山公園，希望大師能於山頂建一佛寺。但因大師台北法務繁冗，遂未積極進行，直至一九六三年二月開始建寺，翌年十一月竣工，並舉行落成典禮的壽山寺，這是佛光山最早創建的道場。

壽山寺興建後，由於大師常往來於宜蘭、台北弘法，其間幸得月基長老、煮雲法師，及善定、慧定二位法師的鼎力護持，及諸多善信的財力、人力、心力布施，壽山寺展開了弘法度眾工作。

一九六五年，大師感於若欲佛法興隆，提高佛教地位、提昇信眾素質，培育佛教人才乃刻不容緩之事，故於壽山寺創辦壽山佛學院。

雖然財力常常捉襟見肘，難以支付學院龐大開支，但大師仍然「日日難過日日過」的支撐著。為度難關，不提倡趕經懺的大師，通宵達旦一人至殯儀館誦經念佛，為的是要募得教育基金，讓學生安心學道。如今，在各地住持一方的僧侶，大多出身於壽山佛學院。

當年大師所寫「壽山寺創建的緣起」木匾額，歷經四十幾年歲月仍懸掛壽山寺三樓：「今寺雖成、弘法利生之事業尚待建樹，雲之創寺之願實為弘法利生也，凡本寺住眾乃護法信徒，應體諒創寺之苦心，秉開山之志願，無廢佛子之責，不做意氣用事，不為名利之爭，克勤克儉，上求下化，自利利他，自覺覺人，使自身品德日增，社會老幼有養，方不愧為壽山寺之住眾及信徒也。

壽山寺永為十方僧伽道場，非出家眾不得任住持、監院，在家信徒只可護法，不得假財團法人之名，安立管理人之實，更不得妄為干涉寺政，他日住持一職，宜由寺眾中出家者，公選有德有學有能力弘法利生者任之，望雲之信徒，當恪遵守，毋或廢弛，庶可不負四恩而三有均資也。」

這一塊記載大師開山精神及本山宗風的木匾額，透露出大師的睿智，為僧信立下清規。