嘉義縣「水上」鄉地理位置特殊，北回歸線經過，是嘉義縣的幾何中心，地處熱帶與亞熱帶分界點。嘉義縣立水上國中，民國四十八年創校，校徽是第三任校長楊日耀任內，由美術老師黃昭雄手繪完成的，中間幾何曲線，取自第五代北回歸線標誌。線條簡單，含義卻非常深遠。

其一：象徵水上地區擁有特殊的地理環境—北回歸線經過，意涵水上國中與世界脈動相聯繫。其二：經緯度的座標，指引莘莘學子，人生努力的方向。

顏色採自國旗的藍、白、紅三種色系，象徵宏觀的國家觀念，白色為底，代表坦白無私，藍色代表光明純潔，紅色代表熱情奔放。外圍由三個圓弧所包容，象徵對真、善、美圓滿人生的追求。

校長魏昭雄秉持「敦品力學」的校訓，要同學們積極樂觀，感恩關懷，在教師諄諄教誨下，創新學習，激發潛能，積極踏實，追求卓越，心懷鄉土情，放眼國際觀，使成文質彬彬的青少年。