醫師建議，一般民眾五十歲時，就可以考慮做第一次直腸及結腸檢查，而一級血親內有結腸直腸癌病史的民眾，則建議提前至四十歲，如果個性較容易緊張，建議選擇無痛的大腸鏡檢查，以免因怕痛而錯過了早期診斷及治療的良機。

目前一般醫療院所提供的大腸癌篩檢方式包括：

(1)結腸直腸癌篩檢工具：糞便潛血反應檢查、下消化道攝影、乙狀結腸鏡檢查以及全大腸鏡檢查。

(2)國民健康局建議五十至六十九歲民眾，每兩年做一次糞便潛血反應檢查。目前各縣市衛生局（所）均有提供此項服務。

北醫健康中心王森德主任提醒說，一般大腸癌的篩選大多採用糞便潛血反應檢查，再加上乙狀結腸鏡的檢查，但根據新英格蘭醫學期刊報告，若只做大便潛血反應檢查及乙狀結腸鏡的檢查，仍有四分之一的患者，無法發現已罹患大腸癌。

因為有一部分大腸癌發生的位置，是在右側的大腸（包括升結腸及盲腸），而乙狀結腸鏡的檢查無法深入此處。此外，根據日本國立癌症中心的報告，近年來，右側大腸癌的發生率有相對增加的情形。所以，大腸癌的篩檢建議選擇賴完整的大腸鏡檢查。

雖然傳統下消化道鋇劑雙重造影，也可做為大腸癌的篩選，但其缺點是，對大腸息肉或早期大腸癌的檢測率低於大腸鏡檢查，且無法取出病灶組織，進一步做病理切片檢查。