花蓮規模六強震發生過後，截至昨晚七時，已經發生二百四十三次餘震。氣象局地震測報中心表示，昨仍發生多起規模四以上的地震，顯示地震活動仍在高峰期，還未有趨緩跡象，預期未來兩周餘震會相當頻繁，而且無法排除規模四、甚至規模五的餘震發生。

花蓮強震後，前天晚間十一時二十一分晚上再發生規模五點七地震，是主震後最大的餘震，昨天上午八時五十四分吉安鄉也發生規模四點八餘震，花蓮縣鹽寮測得最大震度則高達六級，是目前震度最大的一次。

氣象局地震測報中心主任陳國昌強調，地震衰減的過程，不像一般人想像會從規模五、四、三遞減，偶爾會有較大餘震，但次數在預期範圍內就不必擔心。不過他也說，這次地震衰減確實比較慢，但震源機制為破碎帶的能量釋放，過程中偶有大規模餘震或規模四點五以上的中型餘震。

對於這次地震成因，地震測報中心表示仍在持續觀察，較確定的是，看起來是因為兩個板塊碰撞、擠壓，造成表面破碎帶的地震。預期頻繁餘震的情形還會維持一、兩天，若逐漸趨緩，發生較大地震機率將降低。

至於跟米崙斷層是否有關聯，氣象局表示需要更深入的研究。不過氣象局前局長辛在勤受訪時表示，米崙斷層在陸地上全長七點二公里，若要引發規模六地震，斷層需往外海延伸二十、三十公里才符合，以此長度不太可能連續發生規模六、五點七地震，推測米崙斷層關聯性低。