由善化或安定交流道約十分鐘車程，便抵達緊鄰台南科學工業園區善化鎮的慧慈寺。慈慧寺佔地千餘坪，鄰近鄉鎮有新市鄉、山上鄉、麻豆鎮、佳里鎮、大內鄉等，十多年來，接引無數的人走進佛大門。

一九六七年，善化鎮的李知己、李海庚閱讀星雲大師著作，興起籌設佈教所的念頭，但為實現即相繼往生；一九六八年八月，一些在家信眾便自組成立佈教會，次年由鄭偉聲居士引導，李居士領隊，參訪佛光山，並蒙大師開示，而結下創寺之緣。一九七○年，黃信國、蔡真奇、楊浴德、林士人、李金生等人在慶安宮發起善化念佛會，恭請星雲大師指導。畢竟念佛會設址在神廟，容易遭世人對佛教誤解，一九七九年，遂由黃信國居士等代表到佛光山，表明建寺之意，並獲星雲大師首肯。民國一九七九年，首任住持慈嘉法師、監寺依德法師賃屋於道場籌建地旁，正式展開弘法、建寺之工作，是年七月，恭請星雲大師主持破土典禮，定名為「慧慈寺」，於民國七十年落成。

寺內有三分之屬於幼稚園教學園地，「慧慈幼稚園」在首任園長慈嘉法師、主任依詮法師及各位老師的耕耘下，設立以來，時獲教育局評鑑為特優的教育機構。

庭園廣懋，景觀規劃十分優美，大殿前有兩棵老玉蘭樹，枝葉繁茂，因逢花開時節，陣陣香氣，隨風撲鼻。大殿內供奉西方三聖，十分莊嚴，地下層設齋堂，殿後建講堂和大寮，旁有客堂和辦公室。

慧慈寺不論在幼教或弘法佈教活動，為地方帶來法雨的滋潤。近三十年來，接引無數民眾走進正信佛教的大門。為積極落實「寺院學校化」的理念，除各項法會共修外，還開設各種社教班。為擴展失學老信徒的生活內容，社友「基礎中文班」、「菩提合唱團」及「菩提學苑」；針對中青年設友有「佛學研習」、「抄經讀書」、「新聞寫作」、「素食烹飪」、「瑜珈」、「太極拳」、「小提琴」、「彼拉提斯」等進修課程；更為兒童規劃了「書法」、「讀書會」、「讀經」等課程。

在慧慈寺裡，除了感受到佛寺的幽靜，佛菩薩的莊嚴，庭園之美與從幼稚園傳出的孩童嬉戲歡笑聲，也讓人心生平和愉悅。