人類透過眼睛、耳朵等感覺器官，與所居環境產生了認知作用，這些發生各種不同途徑感覺作用，佛門名之為「六根」一詞。《佛光大辭典》解釋說（一二八四）：「六種感覺器官，或認識能力。根，為認識器官之意。即眼根（視覺器官與視覺能力）、耳根（聽覺器官及其能力）、鼻根（嗅覺器官及其能力）、舌根（味覺器官及其能力）、身根（觸覺器官及其能力）、意根（思惟器官及其能力）。前五種又稱五根。五根乃物質上存在之色法，即色根……意根則為心之所依生起心理作用之心法，即無色根。」

又《摩訶止觀》提到一般人多是（大正四六、四三下）：「六根樂六塵，非是凡夫淺智弱志所能降伏，唯有智慧、堅心、正念，乃能降伏。」若更進一步問：「六根清淨是什麼的樣貌？」《摩訶止觀》特別指出修行人（大正四六、一二九上）：「若能安忍，即能成就如來行有功德，所謂六根清淨之報相也。」即知一昧壓抑與逃避，絕非真正的解決之道；而學習如何安忍，才是真正的化解之道。至於該如何令六根清淨，在《摩訶止觀》進一步解釋說（大正四六、四四下）：「前呵五欲，乃是五根對現在五塵發五識；今棄五蓋，即是五識轉入意地，追緣過去逆慮未來五塵等法，為心內大障，喻如陶師身中有疾不能執作。蓋亦如是，為妨既深，加之以棄，如翦毒樹，如檢偷賊，不可留也。」

總之，修習六根清淨有什麼好處？《禪宗決疑集》說（大正四八、一○一四中）：「六根清淨，萬慮咸消。」眼睛、耳朵等並沒有本質上的好與壞；而在於吾人的心，妄念若能降伏下來，則六根也能有大用。