藥師如來是與娑婆世界非常有緣的一位聖者，原因在於其尚未成佛前所發的十二大願，願願以救度苦難眾生為目標，信奉佛教的人堅信，只要勤拜藥師如來、學習其德行，必能往生藥師琉璃淨土。
民國二十二年，時任考試院院長的戴季陶，於寶華山啟建藥師法會，領導大眾效法藥師佛那樣發十二大願。


一、願民國人民，信仰堅固，確實信行忠孝仁愛信義和平八德，相待以誠，相接以禮，表裡如一，心口相應，團結一致，永遠不渝。

二、願民國人民，刻苦自勵，克勤克儉，富者濟人以財，智者濟人以道。財不令藏於地，學不令私於身，營共同之事業，成共同之社會。

三、願民國人民，愛護國家，服務公眾，實行主義，守法奉公，俾約法能行，憲法早布，國基鞏固，政治修明。

四、願青年男子，回心轉意，進德修業，堅其意志，強其身體，修其言行，廣其智識，力矯浮佻之時弊，作真實之功夫，養成耐勞苦，守紀律之性行，俾在家為克家之子弟，在社會為有用之人才，在國家為忠實之人民，然後方能為國為民，擔當大事。

五、願青年女子，一齊覺悟，特宜養其慈愛和平之純德，治家教子之常識，為妻為母，保育後代。民族之生存發展責任，端在於女性同胞，盡其天賦之職責，發揮其自然之良能，俾社會受慈育之恩，萬代沾祥和之德，方為愛國愛民，愛護人類，愛護國家之正道。

六、願一切壯年人民，努力修為，不貽少年老年以憂患辛苦之境遇。在官者廉潔奉公，營業者誠實任事，刻苦耐勞，勇猛精進，上承先德，下啟後人。

七、願中國國民黨全體同志，親愛精誠，團結一致，拋棄嫌怨，互相扶持。念先烈創業之艱難，知國民責善之殷重，虛心平氣，矢信矢忠，奉行主義，努力建設。納全國之忠言，容全國之人才，以盡其救國之責，成其建國之功。

八、願國民政府，上自主席，下迄僚屬，中央地方文武官吏，履行誓言，奉行法令，廉潔勤慎，愛國如家，體總理天下為公之心，繼先烈捨身救國之志，於權利則盡量忍讓，於責任則奮勇承擔。忠於國家，愛護人民，容納賢能，接受忠告，提攜後進，尊重前賢，共濟時艱，同成大業。

九、願全國同胞，漢滿蒙回藏以及回疆，乃至西南諸省山間民族，共存天下為公之大心，同發團結國族之大願。以三民主義為依歸，則共信斯立；以忠信篤敬律言行，則互信以固。分多潤寡，人人存乎慈悲；截長補短，事事行於方便。同心同德，並育並行，復興富強安樂之中華，有志竟成；造成盡善盡美之民國，後來居上。

十、願世界各國政府人民，共立互助之志，同棄凌暴之心，扶持弱小之民族，建立共守之法治，繼絕舉廢，治亂扶危，厚往薄來，協和共濟。

十一、願佛教大眾，徹底覺悟，發大乘心，行普度事，勿作自了之人，勿泥文字之跡，勿迷於外道邪魔而自犯毗尼，勿惑於世俗財位而妄為趨附，勿迷於鬼神而遺棄眾生，勿迷於成規而阻礙進步。勇猛精進，自覺覺人；悲智雙運，財法兼施。布十善於俗界，行六度於道門，持戒則如山岳之堅，度生則如河海之廣。恢復固有之教義，則本體自是金剛；善用世間之科學，則法器悉為輪寶。然後釋迦教義，根基鞏固，枝葉繁榮，法輪常轉，佛日增輝。

十二、願大慈大悲藥師世尊，運無緣慈，施無畏法，愍念眾生，普垂加被，使人人覺悟，共發至誠，懺既往之夙業，種當來之善果。一切煩惱災障消除無餘，村城國邑布滿佛號經聲，大地山河盡成琉璃世界。千秋萬世，善業昭垂；四海五洲，仁風永被。中華鞏固，民國萬年；萬邦協和，正法永住。