紅麴的主要成分為碳水化合物、蛋白質，但其中含有的神奇成分，卻具有「有病治病，無病強身」的功效，只不過民眾大多對紅麴的保健功能一知半解。

其實早在一千多年前，古人就知道「紅麴」對身體有益─雖然不知道其真正具有那些益健強身的成分，在很多食物中，如紅麴清酒、紅麴葡萄酒、紅麴醋、紅麴醬油、紅麴味噌、紅糟豆腐乳、紅麴香腸、紅糟蛋、蘇武醬鴨、紅糟肉、紅露酒酘酘，會刻意加入紅麴（或紅糟），不少調理食物的書籍，甚至在藥典上，也多所描述紅麴的種種功效。

元朝太醫忽思慧，在《飲膳正要》中提及，紅麴的功效包括「健脾、益氣、溫中」和「紅麴釀酒，破血行藥勢」。《本草綱目》中記載，紅麴可以活血化瘀，治療產後惡露不盡；民間也流傳用紅麴來治療小孩和老人家夜尿及輕微氣喘，功效極為良好。

一九七九年，日本學者遠藤章在紅麴發酵產物中，發現具有降低膽固醇功效的Mnacolin K；玉田英明等學者則在後來的研究中，陸續發現紅麴具有抗血壓與降血糖的功能。我國衛生署也於二○○五年，核准了第一件紅麴健康食品─紅麴降血脂膠囊。

而台大研究團隊也在近年，針對Monascus purpureus NTU 568紅麴進行成分與功效分析，發現Monascus purpureus NTU 568紅麴的發酵產物，具有抑制阿茲海默症、抗氧化與抗發炎的作用，有助於延緩病情惡化、改善記憶力。國際知名的神經醫學雜誌，也證實紅麴可預防阿茲海默症之類澱粉樣蛋白沉積，達到改善記憶的目的。

吃紅麴的好處還不僅止於此，原來，紅麴含有Glucosamine，可預防骨質疏鬆症。近來有些相關研究試著以紅麴餵雞，結果生產出「食用後可降膽固醇的蛋」，已獲美專利。

另外，有研究顯示，紅麴可輔助癌症治療、控制脂肪細胞增大及增多，並可抑制肺癌細胞（LLC）轉移。台大潘子明教授新進研究發現，紅麴用於肺癌、口腔癌的治療也頗具療效。

目前國內生產紅麴相關產品的廠商相當多，包括金穎、晨暉、生達、今朝、穀盛、台新、台酒酘酘等業者。但真正獲得「健康食品許可」的紅麴商品生產廠商，僅有少數五家業者。

潘子明教授指出，紅麴菌種繁多，Monacolin K的含量，也會隨菌種不同而有所差異，依據相關實驗的結果發現，山藥發酵的紅麴，含有最多Monacolin K。

潘子明教授指出，紅麴菌種繁多，monacolin K的含量，也會隨菌種不同而有所差異，依據相關實驗的結果發現，由Monascus purpureus NTU 568紅麴菌利用山藥發酵的紅麴山藥，含有多量monacolin K，而其他紅麴米則未含有活性成分。

紅麴山藥之保健功效，比起傳統之紅麴米或未發酵之山藥，其降低膽固醇、預防動脈粥狀硬化效果更好。以上結果已在國際上有關食品最好的學術期刊《農業與食品化學》發表。至於中國進口的紅麴，絕大多數不含monacolin K，其應不具備降膽固醇等效果，但因價格低廉，國內進口量相當大。