蔡總統撤回司法院正副院長謝文定和林錦芳提名咨文。被解讀為推動司法改革一大挫折，但總統府強調，不會耽誤司改進程。蔡總統將擔任「司改國是會議籌備委員會」召集人，親自領導司法改革。

總統府指出，外界對司改有不好的印象與誤解；若由總統親任司改召集人，溝通會比較順暢，不會陷入「只是法律人自己的改革」。近日公布的蔡總統民調顯示，信任度及支持度都跌破五成。各方認為，總統親自拚司改，是為挽救民調，代價則是被認為政治干預司法。

民主法治國家的權力運作，有權責相符的規則。有法官質疑，一旦行政權與司法權結合，將高度壟斷權力。總統親任召集人，決議後就無轉圜餘地，若做出的決議被發現有問題，總統恐將陷入困境。

蔡英文原安排總統府祕書長林碧炤擔任召集人，避免「總統干預司法」的訾議。司改成效大部分須靠修法落實，則總統不但將行政權結合司法權，又恐將「介入」立法院，結合立法權。且從此次司法院院長、副院長提名風波可以看出，蔡總統無法強力約束黨籍立委，黨的意志未能完全貫徹，未來召開司改國是會議，恐怕難有所成。

有檢察官指出，總統沒必要親任召集人；總統站在第一線，恐無人敢表達反對意見，將使會議成一言堂。更有檢察官呼籲，總統應停止召開全國司改會議，回歸民主國家應有的程序，到立法院進行討論與決議。

司法改革眾說紛紜，所謂「不陷入法律人自己的改革」，是爭議的開端。實務界批評，總統已被特定團體綁架，司改將成寡頭式領導。檢改會批評，民意被少數團體壟斷；開會方式只會將台灣導向萬劫不復的民粹治國，年金改革如此，司法改革亦如此。

民間司改會對司法院正副院長提名，發表聲明，要求「公開並透明化大法官提名流程，公開說明提名標準及期許，完整檢視被提名人過往經歷。」不透明、黑箱之批，近年儼然尚方寶劍，但司法界不贊同總統「看司改團體臉色」。

法官論壇有人發起「自己的司法自己救」活動，認為民間司改團體可任意審查提名人選，法官們也應提名自已心目中適任的人選。法官論壇所要彰顯的，反而是「法律人自己的改革」。

蔡英文執政後，為了落實政見，在總統府成立幾個任務編組的機構，如新南向辦公室、國家年金改革委員會、原民歷史正義與轉型正義委員會，與行政院若干部會執掌疊床架屋。多頭馬車各自為政，可能搶功，可能推諉。

有學者指出，原住民、年金、司改等委員會設在總統府，因為政府體制是偏向總統的雙首長制，重大決策還是掌握在總統府，行政院則較偏向執行面。此一說法又掉入總統制、內閣制的漩渦，在現況下，有媒體質疑，府院陸續成立各種委員會，是否會因此出現人才荒。

這個問題，實則點出總統府「管太多了」。以總統的高度，可以談司法改革的理想，但不宜跳下來，親自主導。

體制上，總統是五院的協調者，若親自站在第一線，雖說拉高層級，彰顯總統的重視，但同時也形同降格。蔡總統親自主導的機構愈多，愈顯示出治國的忙亂。