一九九三年在家人和朋友的支持下，張蕙芬創立了大樹文化，專心致力於台灣自然讀物的出版工作，為什麼取名大樹，因為「每一棵樹都是一個小小自然生態系，有許許多多的生物會在這兒生活。

大樹文化以「大樹」為名，是希望大家從自己身邊最近旳生態開始，去關懷自然、瞭解自然，進而與自然永恆且美好地共存。」他說：「當時完全沒有想到業績等種種問題，只是一心想持續耕耘，讓十年來累積的資源不至於消失，這是大樹文化成立的契機。」

現在回想當年，張蕙芬說：真是大膽。但是，除了自己的喜好，經營大樹十年，他更深切體會到，這一塊也正是台灣教育所欠缺的生命教育，自然科學並非只是知識，而是生命態度，是生活，包括對待動植物與大自然的態度。台灣這一塊還很原始，他希望透過書為沒有聲音的一群生命體發聲。

所幸當時台灣自然科學與環境的意識逐漸抬頭，大樹文化在編輯處理上透過手法轉換內容的呈現模式，一本本有質感、份量，卻不輕薄的書一本本問世。例如《台灣賞樹情報》就是相當成功的，它讓讀者知到強記背誦書名不是最重要的，而是找到葉片的特徵，也就是生物學上的特徵表現；另外《台灣賞鳥地圖》、《台灣紅樹林》等，配合每一個主題，都有不同的介紹方式，自導式地圖的處理讓人耳目一新，讀者反映相當好。