國家衛生研究院最新研究指出，台灣二十五歲以下結核病人高達八成五以上感染「北京現代株」，毒性及抗藥性強，疫苗效力差、恐成防治隱憂。研究團隊指出，卡介苗對「北京現代株」的保護效力，須重新評估。

國衛院感染症與疫苗研究所副研究員杜鴻運表示，台灣民眾普遍接種卡介苗，結核病卻沒被杜絕，大部分肺結核患者感染的是「北京現代株」，間接推測卡介苗預防其他結核菌株效果較好，卻可能無法有效防止「北京現代株」傳染。

國衛院和各大醫院以十年時間，蒐集分析各地、各年齡、各族原住民、榮民、平地漢人結核病菌基因型，結核菌基因型在族群間改變可長達百年以上，結果發現，結核菌基因型分布，充分反映出台灣族群遷移、列強殖民及兩岸交流。

杜鴻運說，目前全世界結核菌株的分布主要有北京株、東非株、西非株、拉丁美洲株、荷蘭株等，而北京株又依基因演化而分為古代株及現代株三型。

大部分國家結核菌株十分「單一化」，如中國大陸逾九成感染者為北京株，日本、南韓情形也類似；但在台灣，研究團隊發現北京株、東非株、拉丁美洲株以及荷蘭株，是目前已知「同時擁有最多結核菌基因型的單一國家」。

研究發現，菌株基因型分布也有族群之分，一般漢人有五成六以上係以「北京株」為主；榮民七成二為北京株、多數為第二型；花蓮原住民五成為荷蘭株；南部排灣族有東非株、北部少部分原住民則有拉丁美洲株。

杜鴻運說，此現象與數千年前南島語系原住民族群遷徒來台有關，如十七世紀有荷蘭、西班牙、葡萄牙殖民以及明鄭統治；十九世紀末期受日本統治五十年，以及一九四九年國民政府遷台，都帶來不同結核菌株分布。

他指出，「北京現代株」是從北京型演化而來，毒性及抗藥性都是最強的。國內二十五歲以下年輕族群的結核病人，高達八成五以上感染目前公認細菌毒性及抗藥性最強的「北京現代株」，即使新生兒就打了卡介苗，保護力仍相對較弱。

杜鴻運強調，分析發現，國內結核病人感染在十五歲後快速上升，與全球研究卡介苗疫苗效力會在十五年後快速下降的結果，不謀而合，凸顯台灣普遍接種卡介苗，但結核病未被杜絕，恐肇因於疫苗效期不夠、效力不足，是結核病防治隱憂。目前包括美國、瑞典、日本都致力於以「基因工程」強化卡介苗疫苗保護力，彌補此一防疫漏洞。

國衛院研究團隊表示，現行的卡介苗採用東京一七二株製作，對北京現代株保護效力，須重新評估。

國衛院下一步將做動物實驗，針對現行卡介苗對不同菌種保護力進行研究，希望釐清北京現代株造成台灣漢族、尤其是青少年罹患肺結核原因。